Из материалов уголовного дела следует, что в ночь на 6 июля 2016 года Бойко и Варакина были замечены вместе в 10 микрорайоне города Нефтеюганска. По данным следствия, до этого дня они не были между собой знакомы. Камеры наблюдения зафиксировали, что мужчина и женщина выехали из города на принадлежащем Бойко автомобиле «Субару» в сторону поселка Сингапай. Однако домой они не вернулись. Их родственники обратились в правоохранительные органы с заявлениями о безвестном исчезновении.

С момента возбуждения уголовного дела следователями, следователями-криминалистами следственного управления, сотрудниками окружного управления МВД России проводились оперативно-разыскные мероприятия, направленные на установление местонахождения пропавших, обнаружения автомобиля Бойко. За это время была обследована большая территория Нефтеюганского района. В качестве приоритетной версии следствием рассматривалось падение автомобиля с пропавшими в водоем.

Для оказания практической помощи в проведении поисковых мероприятий в г.Нефтеюганск прибыли руководство и следователи-криминалисты отдела криминалистического сопровождения следствия (с дислокацией в городе Екатеринбург) Главного управления криминалистики СКР, к поисковым мероприятиям были привлечены водолазы КУ ХМАО-Югры «Центроспас-Югория» из г. Нижневартовска.

Сегодня, в результате совместной работы с применением высокотехнологичной криминалистической техники, в Нефтеюганском районе в протоке Чеускинская на удалении 4 метров от береговой линии водолазами обнаружен автомобиль «Субару», который был поднят с 7-метровой глубины. В ходе осмотра транспортного средства обнаружены два тела, а также документы.

Следствию предстоит воссоздать объективную картину произошедшего, узнать что произошло между новыми знакомыми и почему автомобиль оказался в водоеме. Для  подтверждения личностей погибших и установления причины их смерти уже назначены генетические и судебно-медицинские экспертизы. Расследование продолжается.